O tratamento da doença, no seu estágio inicial, consiste em raspagem subgengival da raiz do dente, removendo o principal agente causador, que é a placa bacteriana e o tártaro, aderidos ao dente. Nos estágios mais avançados da doença, há a necessidade de cirurgias, terapia fotodinâmica (laser) e, por vezes, o uso de antibióticos.
Após o controle da periodontite, é fundamental que o paciente retorne periodicamente ao periodontista para controle da doença. Se o periodontista detectar qualquer foco de doença ativa, será feita a intervenção necessária (raspagem ou cirurgia). Além disso, em toda os retornos o especalista deverá rever como está a técnica de escovação do paciente.
No início as consultas de retorno de controle devem ser em períodos mais curtos, a cada 3 meses, e no caso do paciente estar conseguindo controlar adequadamente a doença, estes períodos podem ser estendidos para 4, ou 6 meses. Em casos onde após anos o paciente se demonstra capaz de manter a doença totalmente sob controle, as vistas ao periodontista podem ser espaçadas ainda mais, passando a ser anuais.